หลายๆท่านคงจะสงสัยว่า " จุลินทรีย์บำบัดน้ำเสียคืออะไร ? ทั้งคำว่า จุลินทรีย์ และ บำบัดน้ำเสีย 

จุลินทรีย์บำบัดน้ำเสีย คือ จุลินทรีย์ที่มีประโยชน์หรือจุลินทรีย์ที่ให้ประโยชน์และมีคุณสมบัติในการย่อยสลายของเสียต่างๆ ในน้ำเสียได้ดี จึงจะได้ชื่อว่า เป็นจุลินทรีย์บำบัดน้ำเสีย ส่วนจุลินทรีย์กลุ่มอื่นๆ ที่ไม่มีคุณสมบัติในการย่อยสลายของเสีย ก็ไม่ถือว่าเป็นจุลินทรีย์บำบัดน้ำเสีย ซึ่งจุลินทรีย์ที่ใช้ในการบำบัดน้ำเสีย (ย่อยสลายของเสียต่างๆ ในน้ำ) ก็มีหลากหลายสายพันธุ์ด้วยกัน แต่พอสรุปได้เป็น 2 กลุ่ม คือ

1. จุลินทรีย์ย่อยสลายของเสีย (บำบัดน้ำเสีย) กลุ่มที่ใช้ออกซิเจนเป็นหลัก ( Aerobic  Bacteria ) 

จุลินทรีย์กลุ่มนี้ก็มีหลากหลายสายพันธุ์ เป็นกลุ่มที่ต้องใช้ออกซิเจนในการเจริญเติบโตและการดำรงชีพขยายเซลล์ รวมถึงการใช้ออกซิเจนในการทำปฏิกิริยาย่อยสลายของเสียต่างๆ ในน้ำเสีย ขาดออกซิเจนไม่ได้ มีอยู่ในธรรมชาติ ดิน น้ำ และอากาศ รอบๆ ตัวของเรา เป็นกลุ่มจุลินทรีย์ที่สามารถดึงมาใช้งานย่อยสลายของเสีย (บำบัดน้ำเสีย) ได้ ถ้าออกแบบระบบบำบัดและสิ่งแวดล้อมได้อย่างเหมาะสม ระบบบำบัดน้ำเสียส่วนใหญ่จะนิยมใช้จุลินทรีย์ย่อยสลายกลุ่มนี้เป็นหลัก แทบจะทุกๆ ระบบบำบัด ซึ่งระบบบำบัดน้ำเสียส่วนใหญ่จะใช้ระบบบำบัดน้ำเสียแบบเติมอากาศ ( มากกว่า 90% ) ระบบนี้จะดึงเอากลุ่มจุลินทรีย์ย่อยสลายที่ใช้ออกซิเจนในธรรมชาติมาใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย (ย่อยสลายของเสีย) โดยการเติมออกซิเจนลงไปในน้ำเสียที่จะทำการบำบัดให้เป็นน้ำดี การบำบัดน้ำเสียจะมีประสิทธิภาพมากหรือน้อย ขึ้นอยู่กับจุลินทรีย์ย่อยสลายเป็นหลัก ปฏิกิริยาการย่อยสลายของเสียต่างๆ ที่เป็นสสารในน้ำเสียจะแปรเปลี่ยนสถานะไปเป็น น้ำ พลังงาน และก๊าซคาร์บอนไดออกไซด์

2. จุลินทรีย์ย่อยสลายของเสีย (บำบัดน้ำเสีย) กลุ่มที่ไม่ใช้ออกซิเจน ( Anaerobic  Bacteria ) 

เป็นกลุ่มจุลินทรีย์ที่มีประโยชน์และมีคุณสมบัติในการย่อยสลายของเสียต่างๆ ในน้ำ ได้เช่นเดียวกันกับกลุ่มจุลินทรีย์ย่อยสลายที่ใช้ออกซิเจน มีอยู่ทั่วๆ ไปในธรรมชาติ ดิน น้ำ และอากาศ จุลินทรีย์กลุ่มนี้อยู่ได้ทั้งในสภาวะมีอากาศออกซิเจนและในสภาวะไร้อากาศออกซิเจน มีหลากหลายสายพันธุ์ ดึงมาใช้งานค่อนข้างยาก ต้องสังเคราะห์ขึ้น ( เพาะเลี้ยงด้วยอุปกรณ์ ) จึงไม่ค่อยนิยมนำมาใช้มามากเหมือนกลุ่มที่ใช้ออกซิเจน แต่มีจุดเด่นตรงที่มีภูมิต้านทานต่อสภาวะแวดล้อมที่วิกฤตได้ดีกว่ากลุ่มแรก ไม่ว่าในน้ำเสียนั้นๆ จะมีออกซิเจนหรือไม่มีออกซิเจนเลย จุลินทรีย์ย่อยสลายกลุ่มที่ไม่ใช้ออกซิเจนกลุ่มนี้ก็สามารถอยู่ได้ตามปกติ ไม่ส่งผลกระทบใดๆต่อการทำงานย่อยสลายของเสียและการดำรงชีพ 

  จะเห็นได้ว่าจุลินทรีย์บำบัดน้ำเสีย (ย่อยสลายของเสียในน้ำเสีย) ทั้งสองกลุ่มที่กล่าวมา ( กลุ่มที่ใช้ออกซิเจนกับกลุ่มที่ไม่ใช้ออกซิเจน ) มีจุดเด่นและจุดด้อยที่แตกต่างกัน  แต่จุดที่เหมือนกันก็คือ เป็นกลุ่มจุลินทรีย์ที่มีประโยชน์และมีคุณสมบัติในการย่อยสลายของเสียในน้ำเสียหรือบำบัดน้ำเสียทั้งคู่ จึงได้ชื่อว่า จุลินทรีย์บำบัดน้ำเสีย